学会设有:地方海事、港航工程、运政管理、航海史研究、淮河船检、咨询服务、集体航运、船闸8个专业委员会。
合肥、亳州、宿州、阜阳、滁州、淮南、蚌埠、六安、安庆、马鞍山、芜湖、铜陵、池州等13个市级学会和1个黄山市直属省学会的会员小组。